Le Collège des médecins du Québec a retiré, en août 2005, ses lignes directrices sur la fibromyalgie qu'il avait publiées en 1996. Les découvertes des troubles systémiques associés à la fibromyalgie, dont ceux du système nerveux central, allaient à l'encontre des idées émises dans ce document. Toutefois, ces lignes directrices ne seront pas remplacées par de nouvelles. Le Collège des médecins passe également sous silence l'existence du Consensus canadien sur la fibromyalgie (voir plus bas) publié en 2004.

« Considérant la quantité et la qualité des publications récentes sur la fibromyalgie, et considérant également, les nombreuses sociétés savantes susceptibles de publier des lignes directrices sur le sujet, le Collège des médecins du Québec n'entend pas publier de mise à jour des lignes directrices publiées en 1996. Afin d'éviter la diffusion d'informations qui ne correspondent plus aux données actuelles de la science médicale, le Collège retirera sans délai les lignes directrices sur la fibromyalgie qu'il a publiées en 1996 ».